Mediante Decreto Supremo Nº 015-2002-ED de 12 de junio de 2002 se aprueba el Reglamento de Organización y Funciones de las Direcciones Regionales de Educación y de las Unidades de Gestión Educativa, en la cual se determina la naturaleza, fines, funciones, estructura orgánica y organización de las Direcciones Regionales de Educación y Unidades de Gestión Educativa.

En cumplimiento a la Sexta Disposición Transitoria de la Ley de Presupuesto del Sector Público para el Año Fiscal 2002, Ley Nº 27573, se dispone que dentro de los 30 días siguientes de publicada dicha norma, el Ministerio de Educación deberá emitir un decreto supremo que contenga disposiciones relacionadas a la reestructuración organizacional y presupuestaria de las referidas Direcciones Regionales Sectoriales.

Asimismo, el Decreto Supremo Nº 015-2002-ED declara en reestructuración los órganos intermedios regionalizados por un período de dos meses, para adecuar transitoriamente la organización y funcionamiento de los actuales órganos desconcentrados del Ministerio de Educación.

La Resolución Vice Ministerial Nº 081-2002-ED aprueba la Directiva N° 009-2002-VMGI-OAAE “Orientaciones para la Reestructuración de los Órganos Intermedios Regionalizados del Ministerio de Educación”, cuyo objetivo es reestructurar las Direcciones Regionales de Educación y establecer las Unidades de Gestión Educativa Local a nivel nacional.

Mediante Resolución Suprema N° 203-2002-ED de 10 de enero de 2003, se aprueba el ámbito jurisdiccional, la organización interna y el Cuadro para Asignación de Personal (CAP) de la Dirección Regional de Educación Junín y de la Unidad de Gestión Educativa Local de Huancayo.

Mediante el Decreto Supremo N° 023-2003-ED, de fecha 19 de septiembre de 2003, se dictan disposiciones de emergencia y reforma de aplicación de la Ley General de Educación N.º 28044. En su artículo 3°, se pone en vigencia las cuatro instancias de gestión educativa descentralizada del sistema educativo nacional según sus finalidades, funciones y competencias, dentro del marco del proceso de descentralización.

En marzo del año 2016, la Unidad de Gestión Educativa Local Huancayo pasa a ser la UNIDAD EJECUTORA Nº 304, convirtiéndose en un nivel de desconcentración administrativa-contable encargada de la ejecución de operaciones presupuestales, recaudación de ingresos, ordenamiento de pagos, registro de información y reportes de metas.

Durante todos estos años, la UGEL Huancayo funcionó en diversos locales y direcciones: DRE Junín; Jr. Jorge Chávez; Jr. Libertad; Jr. Julio C. Tello – El Tambo; Av. 9 de diciembre – Chilca; Av. La Marina – La Victoria; Plaza Principal – Huancán; Prol. Trujillo (Anexo de Incho). Finalmente, en el año 2018, se reubican al moderno local de Jr. Atalaya 1280 – El Tambo, al costado de SUNARP.